Comprender cómo se origina y se mantiene la diversidad de las especies y descubrir qué mecanismos genómicos facilitan los procesos de adaptación de los seres vivos son algunas incógnitas fundamentales que todavía no están resueltas en Biología Evolutiva. En la actualidad, las nuevas técnicas de Secuenciación de Nueva Generación (NGS) permiten abordar cuestiones evolutivas a una escala antes impensable, pero estas tecnologías presentan un gran desafío para la ciencia por su rápida evolución, la difícil aplicación -en especial, en los aspectos analíticos y bioinformáticos-, y los problemas derivados de la gestión, el análisis y la interpretación de un enorme volumen de datos.
Generar sinergias entre grupos de investigación, unificar metodologías de trabajo, y potenciar la transferencia del conjunto de conocimientos (know how) de los equipos especializados en genómica de la adaptación en todo el país son las coordenadas de referencia de AdaptNET, la Red Temática en Genómica de la Adaptación que se ha puesto en marcha con la financiación por el Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO), coordinada a nivel estatal por el catedrático Julio Rozas, del Departamento de Genética, Microbiología y Estadística y del Instituto de Investigación de la Biodiversidad (IRBio) de la Universidad de Barcelona, y en la que participa el profesor de Investigación del CSIC en el Real Jardín Botánico, Pablo Vargas.
AdaptNet: afrontando los retos de futuro en genómica evolutiva
Esta red de excelencia, que aglutina a científicos que son líderes en el campo de la genómica a nivel internacional, permitirá intercambiar conocimientos entre los equipos participantes para abordar de forma eficaz los múltiples desafíos que comporta el estudio genómico de la adaptación.
La red está integrada por 24 laboratorios de 11 centros de investigación de todo el Estado que desarrollan líneas de trabajo de gran proyección científica en disciplinas como genética, genómica, biología evolutiva, zoología, botánica, biología molecular, estadística, biología computacional, bioinformática y campos afines.
AdaptNET es una iniciativa pionera en el ámbito estatal para mejorar los resultados de investigación de proyectos financiados por convocatorias del Plan Nacional I+D+i, impulsar nuevas colaboraciones científicas en el marco de la genómica evolutiva y transmitir al público general los avances generados en este ámbito del conocimiento.
De la genómica a la biología evolutiva
La red de excelencia AdaptNet es una iniciativa impulsada por los expertos, Julio Rozas (Universidad de Barcelona); Pablo Vargas (Real Jardín Botánico-CSIC); Rafael Zardoya (Museo Nacional de Ciencias Naturales-CSIC); David Posada (Universidad de Vigo); Fernando González (Universidad de Valencia); Josefa González (Instituto de Biología Evolutiva, CSIC-UPF); Sebastián Ramos-Onsins (Centro de Investigación en Agrigenómica, CRAG); Carles Vilà (Estación Biológica Doñana-CSIC) y Toni Gabaldón (Centro de Regulación Genómica, CRG).
“AdaptNET puede ofrecer -de hecho, es su misión-, una oportunidad única de trabajar en estrecha colaboración, compartiendo su experiencia para identificar las necesidades y oportunidades de los estudios mediante técnicas NGS, generando la masa crítica necesaria para el enfoque multidisciplinario requerido para extender la Genómica hacia la Biología Evolutiva, y viceversa”, detalla Julio Rozas, coordinador de la red y director del Grupo de Investigación en Genómica Evolutiva y Bioinformática de la Universidad de Barcelona, equipo integrante de la plataforma Bioinformatics Barcelona (BIB).
El estudio de la poliploidía
“En nuestro caso, desde el Real Jardín Botánico nuestro reto es el estudio de la poliploidía, el fenómeno por el cual se originan células, tejidos u organismos con tres o más juegos completos de cromosomas de la misma o distintas especies o con dos o más genomas de especies distintas. Y contribuir con esta especialización en el grupo de las plantas a los objetivos que se ha marcado esta red”, apunta el profesor de Investigación Pablo Vargas.
AdaptNET incluye a grupos que trabajan líneas de investigación relacionadas con organismos modelo y no modelo, especies silvestres y domésticas, radiaciones adaptativas, tecnologías de biología molecular, análisis de datos NGS (RNA-seq, ensamblaje y anotación genómica), estudios teóricos, genómica evolutiva y funcional, sistemática molecular y bioinformática.
Mediante la financiación del MINECO, AdaptNET impulsará la organización de fórums científicos que impulsen el intercambio de conocimientos entre el colectivo investigador (doctorandos, investigadores postdoctorales, responsables de investigación, etc) y facilitará la estancia en centros de investigación para el perfeccionamiento de técnicas, entre otras líneas de actuación.
